MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata chromosome

Total Repeats: 117642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015656	GAG	2	6	244	249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176140
2	NC_015656	GAC	2	6	250	255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
3	NC_015656	CTC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176140
4	NC_015656	GAC	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
5	NC_015656	GAC	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
6	NC_015656	CCGG	2	8	366	373	0 %	0 %	50 %	50 %	336176140
7	NC_015656	CCG	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
8	NC_015656	CGC	3	9	428	436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
9	NC_015656	GC	3	6	435	440	0 %	0 %	50 %	50 %	336176140
10	NC_015656	GCCC	2	8	444	451	0 %	0 %	25 %	75 %	336176140
11	NC_015656	TCT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176140
12	NC_015656	C	6	6	534	539	0 %	0 %	0 %	100 %	336176140
13	NC_015656	CAG	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
14	NC_015656	CGA	2	6	570	575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
15	NC_015656	GCTC	2	8	587	594	0 %	25 %	25 %	50 %	336176140
16	NC_015656	AGGTCG	2	12	608	619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	336176140
17	NC_015656	CGA	2	6	630	635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
18	NC_015656	AGC	2	6	641	646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176140
19	NC_015656	CGG	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176140
20	NC_015656	GCCG	2	8	702	709	0 %	0 %	50 %	50 %	336176140
21	NC_015656	CCG	2	6	714	719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
22	NC_015656	GCGGG	2	10	720	729	0 %	0 %	80 %	20 %	336176140
23	NC_015656	TCC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176140
24	NC_015656	CCG	2	6	740	745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176140
25	NC_015656	GCCG	2	8	752	759	0 %	0 %	50 %	50 %	336176140
26	NC_015656	CGG	3	9	816	824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176140
27	NC_015656	TCA	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176140
28	NC_015656	GCC	2	6	964	969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
29	NC_015656	ACC	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176141
30	NC_015656	CGCC	2	8	1017	1024	0 %	0 %	25 %	75 %	336176141
31	NC_015656	CCCG	2	8	1040	1047	0 %	0 %	25 %	75 %	336176141
32	NC_015656	CGT	2	6	1056	1061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
33	NC_015656	CCGG	2	8	1064	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	336176141
34	NC_015656	CGGG	3	12	1144	1155	0 %	0 %	75 %	25 %	336176141
35	NC_015656	GCT	2	6	1182	1187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
36	NC_015656	GCC	2	6	1213	1218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
37	NC_015656	G	6	6	1221	1226	0 %	0 %	100 %	0 %	336176141
38	NC_015656	TTG	2	6	1259	1264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336176141
39	NC_015656	GGCCT	2	10	1294	1303	0 %	20 %	40 %	40 %	336176141
40	NC_015656	GTCG	2	8	1321	1328	0 %	25 %	50 %	25 %	336176141
41	NC_015656	CGG	2	6	1332	1337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176141
42	NC_015656	CGGT	2	8	1366	1373	0 %	25 %	50 %	25 %	336176141
43	NC_015656	TTG	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336176141
44	NC_015656	GCCGGC	2	12	1415	1426	0 %	0 %	50 %	50 %	336176141
45	NC_015656	TTC	2	6	1439	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
46	NC_015656	TTC	2	6	1457	1462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
47	NC_015656	CGGC	2	8	1512	1519	0 %	0 %	50 %	50 %	336176141
48	NC_015656	GGC	3	9	1517	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176141
49	NC_015656	TCT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176141
50	NC_015656	CTG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
51	NC_015656	TGG	2	6	1569	1574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176141
52	NC_015656	CAG	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
53	NC_015656	CTG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
54	NC_015656	CGT	2	6	1723	1728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
55	NC_015656	CGA	3	9	1807	1815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
56	NC_015656	AGC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
57	NC_015656	CTG	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
58	NC_015656	CGC	2	6	1914	1919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
59	NC_015656	GGCA	2	8	1994	2001	25 %	0 %	50 %	25 %	336176141
60	NC_015656	AGC	2	6	2006	2011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
61	NC_015656	CTG	2	6	2056	2061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176141
62	NC_015656	CAG	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
63	NC_015656	GAC	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176141
64	NC_015656	GAA	2	6	2209	2214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176141
65	NC_015656	AGA	2	6	2253	2258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176141
66	NC_015656	CGC	2	6	2269	2274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176141
67	NC_015656	CGGT	2	8	2337	2344	0 %	25 %	50 %	25 %	336176142
68	NC_015656	CGG	2	6	2415	2420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
69	NC_015656	CCGG	2	8	2435	2442	0 %	0 %	50 %	50 %	336176142
70	NC_015656	CCG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
71	NC_015656	GGC	2	6	2460	2465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
72	NC_015656	GCAGC	2	10	2524	2533	20 %	0 %	40 %	40 %	336176142
73	NC_015656	GCC	2	6	2535	2540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
74	NC_015656	GCC	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
75	NC_015656	GCC	2	6	2554	2559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
76	NC_015656	ACG	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176142
77	NC_015656	ATC	2	6	2669	2674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176142
78	NC_015656	CAC	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176142
79	NC_015656	GCC	2	6	2742	2747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176142
80	NC_015656	GGC	2	6	2761	2766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176142
81	NC_015656	ACG	2	6	2780	2785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176142
82	NC_015656	GGT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176143
83	NC_015656	TGCC	2	8	2891	2898	0 %	25 %	25 %	50 %	336176143
84	NC_015656	GCCC	2	8	2953	2960	0 %	0 %	25 %	75 %	336176143
85	NC_015656	CGG	2	6	3020	3025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176143
86	NC_015656	ACG	2	6	3112	3117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
87	NC_015656	GAC	2	6	3141	3146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
88	NC_015656	ACC	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176143
89	NC_015656	CGGC	2	8	3223	3230	0 %	0 %	50 %	50 %	336176143
90	NC_015656	GCA	2	6	3281	3286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176143
91	NC_015656	GCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176144
92	NC_015656	GCACG	2	10	3363	3372	20 %	0 %	40 %	40 %	336176144
93	NC_015656	CGG	2	6	3422	3427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176144
94	NC_015656	CCG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
95	NC_015656	CAGG	2	8	3824	3831	25 %	0 %	50 %	25 %	336176145
96	NC_015656	CCG	2	6	3857	3862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
97	NC_015656	CAG	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
98	NC_015656	GCT	2	6	3966	3971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
99	NC_015656	GA	3	6	4058	4063	50 %	0 %	50 %	0 %	336176145
100	NC_015656	CTG	2	6	4408	4413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
101	NC_015656	GGA	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
102	NC_015656	TCA	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176145
103	NC_015656	GAC	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
104	NC_015656	GCA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
105	NC_015656	CGC	2	6	4537	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
106	NC_015656	GAC	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
107	NC_015656	AGG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
108	NC_015656	TTC	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176145
109	NC_015656	TGC	2	6	4634	4639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176145
110	NC_015656	TCC	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176145
111	NC_015656	AGC	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176145
112	NC_015656	GGA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
113	NC_015656	CCCG	2	8	4752	4759	0 %	0 %	25 %	75 %	336176145
114	NC_015656	GAA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176145
115	NC_015656	GCC	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176145
116	NC_015656	GC	3	6	4880	4885	0 %	0 %	50 %	50 %	336176145
117	NC_015656	CGCGAC	2	12	5013	5024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336176145
118	NC_015656	GGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176145
119	NC_015656	GACC	2	8	5121	5128	25 %	0 %	25 %	50 %	336176145
120	NC_015656	CGG	2	6	5157	5162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176145
121	NC_015656	ACCAC	2	10	5168	5177	40 %	0 %	0 %	60 %	336176145
122	NC_015656	GAC	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
123	NC_015656	GC	3	6	6133	6138	0 %	0 %	50 %	50 %	336176146
124	NC_015656	GGCC	2	8	6177	6184	0 %	0 %	50 %	50 %	336176146
125	NC_015656	GTCG	2	8	6213	6220	0 %	25 %	50 %	25 %	336176146
126	NC_015656	GCC	2	6	6241	6246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
127	NC_015656	CGA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
128	NC_015656	AGG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176146
129	NC_015656	GCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
130	NC_015656	GC	3	6	6362	6367	0 %	0 %	50 %	50 %	336176146
131	NC_015656	GGT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176146
132	NC_015656	CG	3	6	6390	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	336176146
133	NC_015656	GAC	2	6	6421	6426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
134	NC_015656	GCC	2	6	6438	6443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
135	NC_015656	CGG	2	6	6449	6454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
136	NC_015656	GCG	2	6	6475	6480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
137	NC_015656	GTCGCC	2	12	6502	6513	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	336176146
138	NC_015656	GAC	2	6	6523	6528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
139	NC_015656	ACCG	2	8	6592	6599	25 %	0 %	25 %	50 %	336176146
140	NC_015656	CTCGG	2	10	6736	6745	0 %	20 %	40 %	40 %	336176146
141	NC_015656	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
142	NC_015656	TGG	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176146
143	NC_015656	GCT	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
144	NC_015656	CGC	2	6	6918	6923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176146
145	NC_015656	CGA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
146	NC_015656	GGCCGG	2	12	6975	6986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176146
147	NC_015656	AGGCCC	2	12	6992	7003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	336176146
148	NC_015656	ACG	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176146
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150	NC_015656	GTC	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176146
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152	NC_015656	AAG	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176146
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155	NC_015656	CTG	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
156	NC_015656	TCG	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
157	NC_015656	GGGCA	2	10	7337	7346	20 %	0 %	60 %	20 %	336176147
158	NC_015656	CTG	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
159	NC_015656	CG	3	6	7462	7467	0 %	0 %	50 %	50 %	336176147
160	NC_015656	CCGCG	2	10	7474	7483	0 %	0 %	40 %	60 %	336176147
161	NC_015656	TCGAGA	2	12	7488	7499	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336176147
162	NC_015656	CGGGC	2	10	7506	7515	0 %	0 %	60 %	40 %	336176147
163	NC_015656	ACG	2	6	7557	7562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176147
164	NC_015656	CTG	2	6	7571	7576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176147
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168	NC_015656	CGG	2	6	7637	7642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176147
169	NC_015656	CGA	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176147
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177	NC_015656	CCGG	2	8	7949	7956	0 %	0 %	50 %	50 %	336176147
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195	NC_015656	GAC	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176147
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246	NC_015656	GAA	2	6	11418	11423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336176149
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249	NC_015656	GCT	3	9	11553	11561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176149
250	NC_015656	GCT	2	6	11565	11570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176149
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253	NC_015656	GGCC	2	8	11715	11722	0 %	0 %	50 %	50 %	336176149
254	NC_015656	ACC	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176149
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259	NC_015656	TAC	2	6	12108	12113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176150
260	NC_015656	CCG	2	6	12116	12121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176150
261	NC_015656	TCG	2	6	12198	12203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
262	NC_015656	CCG	2	6	12247	12252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176150
263	NC_015656	ACG	2	6	12270	12275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176150
264	NC_015656	CG	3	6	12312	12317	0 %	0 %	50 %	50 %	336176150
265	NC_015656	TCG	2	6	12318	12323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
266	NC_015656	ACC	2	6	12342	12347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176150
267	NC_015656	GCTC	2	8	12385	12392	0 %	25 %	25 %	50 %	336176150
268	NC_015656	ACGGCA	2	12	12423	12434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176150
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270	NC_015656	TGC	2	6	12513	12518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
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275	NC_015656	CCA	2	6	12648	12653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176150
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279	NC_015656	TCG	2	6	12792	12797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176150
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283	NC_015656	GAG	2	6	12869	12874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176150
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286	NC_015656	ATC	2	6	13031	13036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176150
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294	NC_015656	ACC	2	6	13284	13289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176150
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361	NC_015656	CG	3	6	16882	16887	0 %	0 %	50 %	50 %	336176152
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367	NC_015656	CG	3	6	17100	17105	0 %	0 %	50 %	50 %	336176152
368	NC_015656	TGA	2	6	17111	17116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176152
369	NC_015656	GGAGC	2	10	17125	17134	20 %	0 %	60 %	20 %	336176152
370	NC_015656	CGACC	2	10	17253	17262	20 %	0 %	20 %	60 %	336176152
371	NC_015656	ATT	2	6	17273	17278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336176152
372	NC_015656	TCGGC	2	10	17310	17319	0 %	20 %	40 %	40 %	336176153
373	NC_015656	GAC	2	6	17320	17325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176153
374	NC_015656	CTG	2	6	17349	17354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
375	NC_015656	CGGT	2	8	17395	17402	0 %	25 %	50 %	25 %	336176153
376	NC_015656	CGT	2	6	17444	17449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
377	NC_015656	CAT	2	6	17510	17515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176153
378	NC_015656	TGC	2	6	17526	17531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
379	NC_015656	CGG	2	6	17647	17652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176153
380	NC_015656	CG	3	6	17742	17747	0 %	0 %	50 %	50 %	336176153
381	NC_015656	TCG	2	6	17749	17754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
382	NC_015656	CCAC	2	8	17942	17949	25 %	0 %	0 %	75 %	336176153
383	NC_015656	GCC	2	6	18009	18014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176153
384	NC_015656	GCT	2	6	18071	18076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
385	NC_015656	CCG	2	6	18088	18093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176153
386	NC_015656	TTC	2	6	18204	18209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176153
387	NC_015656	ACT	3	9	18223	18231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176153
388	NC_015656	CTG	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176153
389	NC_015656	CGGCC	2	10	18296	18305	0 %	0 %	40 %	60 %	336176153
390	NC_015656	CAT	2	6	18338	18343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176153
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392	NC_015656	CCCGG	2	10	18541	18550	0 %	0 %	40 %	60 %	336176153
393	NC_015656	AC	3	6	19078	19083	50 %	0 %	0 %	50 %	336176154
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395	NC_015656	CG	3	6	19207	19212	0 %	0 %	50 %	50 %	336176154
396	NC_015656	GC	3	6	19218	19223	0 %	0 %	50 %	50 %	336176154
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401	NC_015656	CTT	2	6	19309	19314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176154
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495	NC_015656	GGGC	2	8	22684	22691	0 %	0 %	75 %	25 %	336176157
496	NC_015656	CTGG	2	8	22714	22721	0 %	25 %	50 %	25 %	336176157
497	NC_015656	CGG	2	6	22723	22728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176157
498	NC_015656	CGA	2	6	22729	22734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176157
499	NC_015656	GCC	2	6	22736	22741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176157
500	NC_015656	CGCT	2	8	22748	22755	0 %	25 %	25 %	50 %	336176157

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